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莫斯科物理技術學院的研究人員及其同事首次成功地使用 RNA 測序作為癌癥診斷免疫組織化學的替代方法。他們的研究發(fā)表在Biomedicines上。

常規(guī)用于癌癥診斷的方法依賴于腫瘤組織切片的免疫組織化學染色。它允許檢測表征惡性生長的標記蛋白的存在和濃度。該過程包括將腫瘤樣本浸入熱石蠟中。冷卻后，一塊石蠟化組織被切成薄片，然后染色并用顯微鏡研究。由此產生的圖像表明腫瘤是否是惡性的以及它的分子類型是什么。這些信息對于選擇正確的療法至關重要。

另一種方法，RNA 測序涉及確定細胞中存在的每個 RNA 的序列和分子數量。生成的數據稱為轉錄組，反映了細胞中所有基因的活性。為了分析如此龐大的數據陣列，生物信息學家采用專門的算法并為不同的人體細胞和組織編譯轉錄組數據庫。

最近發(fā)表在《生物醫(yī)學》上的論文的作者提出，RNA 測序可作為傳統免疫組織化學染色的替代和補充技術。在這種方法下，可以在分析中使用相同的石蠟化腫瘤碎片。這意味著不需要額外的活檢，并且這兩種技術將很容易結合起來。

“我們首次表明，這兩種方法的結果對于選定的一組生物標記物是完全一致的。只是免疫組織化學需要更多的實驗——每個生物標記物都需要一個實驗——這意味著需要更多的生物材料. 反過來，RNA 測序使我們能夠定量描述所有蛋白質編碼基因的工作，其中大約有 20,000 個!首席研究員 Anton Buzdin 說，他是 MIPT 轉化基因組生物信息學實驗室的負責人，也是 Oncobox 研究部門的負責人。

在他們的研究中，研究人員表明通過 RNA 測序測量的四種腫瘤標記基因的表達水平與免疫組織化學染色的結果之間存在明顯的相關性。

“我們相信 RNA 測序在醫(yī)學診斷方面有著廣闊的前景。希望我們的最新研究能讓這個未來更近一點，”Buzdin 補充道。

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